008170329s2015                                          c    eng  d
■001CHIMSIN00470110
■00520170418113910
■020    ▼a9781339523439
■035    ▼a(UMI)AAI10026262
■040    ▼aUMI▼cUMI▼dPQKOR
■08204▼a361▼222
■090    ▼aPh.D.
■1001  ▼aSommerhalter,  Kristin  McCarthy.
■24510▼aUse  of  molecular  typing  methods  in  characterizing  MRSA  infections  in  Ohio▼h[e-book]
■260    ▼aAnn  Arbor,  MI▼bUMI  Dissertations  Publishing▼c2015
■300    ▼a244  p
■500    ▼aAdviser:  Kurt  B.  Stevenson.
■5021  ▼aThesis  (Ph.D.)▼bThe  Ohio  State  University▼d2015.
■520    ▼aMethicillin-resistant  Staphylococcus  aureus  (MRSA)  is  a  genetically  heterogeneous  bacterial  organism  responsible  for  causing  significant  human  disease.  Molecular  strain  typing  of  MRSA  is  regularly  implemented  to  enhance  surveillance  procedures,  supplement  outbreak  control  programs,  and  to  characterize  evolutionary  patterns  of  MRSA.  Numerous  molecular  strain  typing  methods  have  been  developed  to  characterize  MRSA,  but  all  have  significant  advantages  and  disadvantages.  Four  of  the  more  commonly  used  typing  methods  include  pulsed  field  gel  electrophoresis  (PFGE),  Staphylococcal  protein  A  (spa)  typing,  repetitive  element  PCR  (rep-PCR)  typing,  and  Staphylococcal  chromosome  cassette  mec  (SCC  mec)  typing.
■520    ▼aThe  objective  of  this  dissertation  was  to  investigate  the  use  of  molecular  typing  methods  in  characterizing  MRSA  using  a  set  of  isolates  collected  from  eight  hospitals  in  Ohio  from  2007  through  2010.  Our  three  specific  aims  were:  1.)  To  evaluate  the  discriminatory  power  and  concordance  of  rep-PCR,    spa,  SCCmec  and  PFGE  typing  in  the  molecular  characterization  of  MRSA  2.)  To  characterize  the  association  between  spa  type  assignment  and  MRSA  infection  presentation  and  3.)  To  describe  the  distribution  and  diversity  of  MRSA  isolate  strain  types  across  seven  community  hospitals  in  Ohio  collected  over  a  one  year  period.  In  our  study  we  found  that  rep-PCR  typing  had  the  highest  discriminatory  power  of  the  four  typing  methods,  and  that  there  was  high  directional  concordance  between  rep-PCR  typing  and    spa  typing,  PFGE  typing,  and  SCCmec  typing.    spa  typing  also  exhibited  high  directional  concordance  with  PFGE  and  SCCmec  typing.  We  also  found  a  lack  of  independence  between    spa  type  assignment  and  MRSA  specimen  type.  Specifically,  isolates  assigned  to  spa  type  2  were  more  likely  to  come  from  a  blood  specimen  than  a  skin/soft  tissue  specimen,  and  isolates  assigned  to  spa  type  1  were  less  likely  to  come  from  either  a  blood  specimen  or  a  sputum  specimen  than  from  a  skin/soft  tissue  specimen.  Finally,  we  found  that  two  rep-PCR  types  persisted  at  different  time  intervals  across  all  seven  community  hospitals,  and  that  there  was  high  rep-PCR  type  diversity  among  our  isolates  at  each  hospital.  We  also  found  evidence  that  rep-PCR  typing  might  be  useful  in  detecting  outbreak  strains.  There  were  two  spa  types  that  persisted  across  also  seven  hospitals  across  the  entire  study  period,  and  there  was  moderate  diversity  in  spa  type  assignment  among  the  isolates  at  each  hospital.  These  differences  give  some  support  to  using  rep-PCR  typing  over  spa  typing  for  short  term  MRSA  surveillance.
■520    ▼aMolecular  strain  typing  is  a  ubiquitous  tool  for  characterizing  MRSA,  but  there  are  a  number  of  different  typing  methods  available  to  use.  Our  results  suggest  that  rep-PCR  typing  is  highly  concordant  with  other  popular  typing  methods  and  is  a  useful  tool  for  short  term  surveillance.  We  also  found  that    spa  typing  is  associated  with  the  manifestation  of  an  MRSA  infection.  Future  studies  should  focus  on  correlating  these  strain  type  patterns  to  virulence  factors  associated  with  persistence  and  pathogenesis.
■650  4▼aPublic  health
■650  4▼aEpidemiology
■71020▼aThe  Ohio  State  University▼bPublic  Health.
■793    ▼aEnglish
■85640▼uKTLA/2016/10026262.pdf